Dopo aver trascorso gli anni dell’infanzia e dell’adolescenza in vari collegi svizzeri, negli anni sessanta, Fleur Jaeggy si trasferisce a Roma. Qui diventa intima amica della scrittrice austriaca Ingeborg Bachmann e conosce alcuni tra i maggiori scrittori dell’epoca come Thomas Bernhard.
Dal 1968 vive a Milano, ed inizia la sua collaborazione con la casa editrice Adelphi. Il successo arriva con I beati anni del castigo, premio Bagutta 1990. All’attività di narratrice affianca quella di traduttrice e saggista. Traduce Marcel Schwob, Thomas de Quincey, Robert Schumann e scrive su John Keats e Robert Walser. I suoi romanzi sono tradotti in diciotto lingue.20

Scrive, inoltre, per il teatro: Un tram che si chiama Tallulah è stato presentato nel 1975 al Festival dei Due Mondi di Spoleto (per la regia di Giorgio Marini) e nel 1984 a Lugano al Teatro La Maschera, per la regia di Alberto Canetta.

In musica, ha collaborato ai testi per Franco Battiato usando spesso lo pseudonimo di Carlotta Wieck.

1980 – Patriots – Franco Battiato – autrice del testo de Le aquile;

1983 – Orizzonti perduti – Franco Battiato – coautrice del testo di Tramonto occidentale;

1988 – Fisiognomica – Franco Battiato – autrice del testo de L’oceano di silenzio

1988 – Fisiognomica (edizione spagnola) – Franco Battiato – autrice del testo de L’oceano di silenzio;

1991 – Come un cammello in una grondaia – Franco Battiato – coautrice del testo di Come un cammello in una grondaia;

1993 – Caffè de la Paix – Franco Battiato – autrice del testo di Atlantide;

1996 – L’imboscata – Franco Battiato – voce recitante e coautrice del testo di Splendide previsioni;

1997 – La emboscada (edizione spagnola de L’imboscata) – Franco Battiato – coautrice del testo di Espléndidas previsiones;

1998 – Gommalacca – Franco Battiato – voce recitante e autrice del testo di E.Shackleton;

1999 – Fleurs – Franco Battiato – autrice del testo di Ghost track;

2001 – Ferro battuto – Franco Battiato – voce recitante e autrice del testo di Öde;

2001 – Hierro forjado (edizione spagnola di Ferro battuto) – Franco Battiato – voce recitante eautrice del testo di Öde;

2004 – Dieci stratagemmi – Franco Battiato – autrice del testo de Il sogno;

2014 – Joe Patti’s experimental group – Franco Battiato – autrice del testo di Le voci si faranno presenze e L’isola Elefante;

Singoli: 1993 – Atlantide – Franco Battiato – autrice del testo;

1996 – Splendide previsioni – Franco Battiato – autrice del testo

Nel 2003 il Times Literary Supplement assegna all’opera Proleterka il titolo di libro dell’anno.

Attualmente Fleur Jaeggy è sposata con lo scrittore ed editore Roberto Calasso, nel 2014 pubblica il suo nuovo libro, Sono il fratello di XX edito da Adelphi e nel 2015 si aggiudica la dodicesima edizione del Premio Letterario Internazionale Giuseppe Tomasi di Lampedusa.